Коллаген типа 5 альфа 1 (COL5A1). Выявление мутации C267T (регуляторная область гена)
Маркер связан с активностью синтеза коллагена, входящего в состав скелетных мышц, сухожилий. Исследуется для выявления генетической предрасположенности к тендопатиям при активных тренировках, в частности травмам ахиллова сухожилия.
Метод исследования
Полиморфизм длин рестрикционных фрагментов.
Какой биоматериал можно использовать для исследования?
Венозную кровь, буккальный (щечный) эпителий.
Как правильно подготовиться к исследованию?
Специальной подготовки не требуется.
Название гена - COL5A1
OMIM - *120215
Локализация гена на хромосоме - 9q34.3
Функция гена
Ген COL5A1 кодирует белок альфа-1 цепи коллагена V типа.
Генетический маркер C267T
Участок ДНК в регуляторной области гена COL5A1 в позиции 267, в которой происходит замена цитозина (С) на тимин (Т), называется генетическим маркером С267Т (rs12722).
Возможные генотипы
- С/С
- С/Т
- Т/Т
Встречаемость в популяции
Встречаемость аллеля С в европейской популяции составляет 40 %.
Ассоциация маркера с заболеваниями
- Тендопатия ахиллова сухожилия
Общая информация об исследовании
Коллаген, главная макромолекула соединительной ткани, является наиболее распространенным белком в животном мире. Он обеспечивает внеклеточный каркас у всех многоклеточных организмов. В тканях человека существует несколько различных типов коллагена. Благодаря ему соединительная ткань прочная и эластичная.
Коллаген - внеклеточный белок, но он синтезируется в виде внутриклеточной молекулы предшественника (препроколлагена), которая трансформируется (процессинг) в проколлаген и далее в коллаген.
Наиболее характерная особенность коллагеновых молекул - это их трехспиральная структура. Каждая субъединица, или альфа-цепь, представляет собой левозакрученную спираль, у которой на виток приходится по три аминокислотных остатка. Три такие левые спирали закручиваются далее в правую суперспираль, и в результате формируется жесткая палочковидная молекула. Затем эти молекулы коллагена ассоциируются в фибриллы.
Основополагающую роль в фибриллогенезе играют коллагены 5-го типа. Они участвуют в регуляции сборки и роста коллагена 1-го типа - наиболее широко распространенного коллагена, который обнаруживается в самых различных тканях. Коллаген 5-го типа также является важным структурным компонентом сухожилий и других соединительных тканей.
В 3’-UTR (3’-нетранслируемом регионе) гена COL5A1, кодирующего белок - коллаген 5-го типа, располагаются регуляторные элементы - сайты связывания с микроРНК (регуляторными молекулами). Ген COL5A1 полиморфен, т. е. может быть представлен в виде двух вариантов - аллелей. Замена нуклеотида С на Т может происходить в области 3’-UTR гена COL5A1 в позиции 267, располагающейся в непосредственной близости с двумя предполагаемыми сайтами связывания с молекулами микроРНК. Данный участок ДНК называется генетическим маркером С267Т (или rs12722). Аллель гена Т получил название "менее гибкий", что характеризует состояние сухожилия человека, имеющего в генотипе аллель Т.
Обе копии гена COL5A1 обеспечивают нормальное формирование коллагеновых фибрилл. И полиморфизм гена, проявляющийся в однонуклеотидной замене, вносит лишь относительно небольшие изменения в стабильности мРНК COL5A1 в пределах нормальных физиологических колебаний (не патологических). Это может приводить к межиндивидуальной изменчивости фибриллогенеза, различиям в механических свойствах и восприимчивости опорно-двигательного аппарата к травмам мягких тканей, а также отличиям в гибкости и выносливости во время бега.
Однако наличие у человека аллеля Т ассоциировано с предрасположенностью к хронической тендопатии ахиллова сухожилия и разрывам передней крестообразной связки. Этот факт важен для выявления генетической предрасположенности к тендопатиям при активных тренировках.
Интерпретация результатов
Результаты исследования должны интерпретироваться врачом в комплексе с другими генетическими, анамнестическими, клиническими и лабораторными данными.
Важные замечания
Для данного маркера не существует понятия "норма" и "патология", т. к. исследуется полиморфизм гена.
Литература
- Р. Марри, Д. Греннер, П. Мейерс, В. Родуэлл. Биохимия человека: В двух томах. Пер. с англ.: - М.: Мир, 1993.
- Gene Variants that Predispose to Achilles Tendon Injuries: An Update on Recent Advances Stuart M. Raleigh and Malcolm Collins, Published online 08, January, 2012, Achilles Tendon, Edited by Prof. Andrej Cretnik
- September A. V. Variants within the COL5A1 gene are associated with Achilles tendinopathy in two populations / [A.V. September, J. Cook , C.J Handley et al.] // Br J Sports Med. - 2009. - V. 43. - P. 357. - 365. [PMID: 18443036]
Описание по материалам Helixbook (18-048).